中平五年秋七月，以射声校尉马日为太尉。马日，是马融的族孙。
八月，初置西园八校尉，以小黄门蹇硕为上军校尉。虎贲中郎将袁绍为中军校尉，屯骑校尉鲍鸿为下军校尉。议郎曹操为典军校尉。赵融为助军左校尉，冯芳为助军右校尉，谏议大夫夏牟为左校尉，淳于琼为右校尉。皆受蹇硕统领。
皇上自黄巾之起，即留心兵戎之事。蹇硕壮健有武略，皇上亲任之，虽大将军亦受其统领。
九月，司徒许相罢。以司空丁宫为司徒。光禄勋南阳刘弘为司空。以卫尉条侯董重为骠骑将军。董重，是永乐太后兄子。
冬十月，青徐黄巾复起。寇略郡县。望气者以为京师当有大兵，两宫流血。皇上想要用厌胜之术阻止，于是大发四方兵，讲武于平乐观下。先起大坛，上建十二重华盖，盖高十丈，坛东北建小坛，复建九重华盖。高九丈。排列步骑数万人，结营为阵。甲子，皇上亲出临军，驻于大华盖下。大将军何进，驻于小华盖下。皇上亲自披甲上马，称无上将军，行阵三匝而还。然后将兵甲授予何进。皇上问讨虏校尉盖勋说：我如此讲武，你以为如何？
盖勋回答说：臣闻先王耀德不观兵。如今敌寇在远而设近阵，不足以激励士兵斗志，只是黩武罢了。
皇上说：你说得对，只恨与君相见太晚。群臣起初没有这么说的。
盖勋对袁绍说：皇上很聪明，只是蔽于左右近习而已。因与袁绍计谋共诛嬖倖。蹇硕惧，出盖勋为京兆尹。
十一月，王国围陈仓。诏复拜皇甫嵩为左将军。督前将军董卓合兵四万人抗拒王国。
张纯与丘力居钞略青徐幽冀四州，诏令骑都尉公孙瓒进讨之。公孙瓒与他们在属国石门交战，张纯等大败，弃妻子，踰塞而走。悉得其所略男女。公孙瓒深入无继，反为丘力居等所围于辽西管子城二百余日，粮尽众溃，士卒死者什五六。
董卓对皇甫嵩说：陈仓危急，请速前去救援。皇甫嵩说：不然。百战百胜，不如不战而屈人之兵。陈仓虽小，城守固备，不是那么轻易可拔的。王国虽强，攻陈仓不下，其众必疲，疲而击之，才是全胜之道。为什么要去救他？王国攻陈仓，八十余日不拔。
六年春二月，王国兵众疲敝，解围去。皇甫嵩进兵攻击，董卓说：不可。兵法说穷寇勿迫，归众勿追。皇甫嵩说：不然。以前我不进击，是为了避其锋芒。如今追击，是待其士气已衰。所追击的是疲敝之师，并不是归众。王国众军将走，莫有斗志。我以整击乱，他们并不是穷寇。遂独进攻击。使董卓为后拒。连战大破之。斩首万余级。董卓大为惭恨，自此与皇甫嵩有隙。
韩遂等共废王国而劫故信都令汉阳闫忠，使他督统诸部。闫忠病死，韩遂等稍争权利，更相杀害。由是遂衰。
幽州牧刘虞到部，遣使至鲜卑中，告以利害，责使送张举张纯首级，厚加购赏。丘力居等闻刘虞至，大喜。各遣使自归。张举张纯走出塞。余众皆降散。刘虞上罢诸屯兵，但留降虏校尉公孙瓒将步骑万人屯兵右北平。
三月，张纯宾客王政杀张纯，传送首级与刘虞。公孙瓒志欲扫灭乌桓，而刘虞欲以恩信招降。于是与公孙瓒有隙。
夏四月，丙子朔，有日食。太尉马日免。遣使即拜幽州牧刘虞为太尉。封容丘侯。
蹇硕忌大将军何进。与诸常侍一道说服皇上遣何进西击韩遂。皇上从之。何进阴知其谋，奏请遣袁绍收徐兖二州兵，须待袁绍还京后再西行，借以稽留行期。初，皇上数失皇子，何皇后生子刘辩，养于道人史子眇家。号为史侯。王美人生子刘协，董太后亲自抚养，号为董侯。群臣请立太子，皇上以刘辩轻佻无威仪，欲立刘协。犹豫未决。会疾笃。将刘协托付于蹇硕。
丙辰，皇上崩于嘉德殿。蹇硕当时在内省，欲先诛何进而立刘协。使人迎何进。假说欲与之计事。何进立即驾往。蹇硕司马潘阳与何进有旧，迎上去以眼色示意，驰马从旁道归营。引兵入屯百郡邸。因称疾不入。
戊午，皇子刘辩即皇帝位，年十四。尊皇后为皇太后，太后临朝。赦天下，改元为光熹。封皇弟刘协为渤海王。刘协年九岁。以后将军袁隗为太傅，与大将军何进参录尚书事。何进既秉朝政，忿蹇硕图己，私下里设法诛杀他。袁绍通过何进亲客张津劝何进诛杀全部宦官。何进以袁氏累世贵宠，而袁绍与从弟虎贲中郎将袁术皆为豪杰所归，而信用之。复博征智谋之士，何顒，荀攸，及河南郑泰等二十余人，以何顒为北军中候。荀攸为黄门侍郎。郑泰为尚书。与他们共为腹心。荀攸，是荀爽的从孙。蹇硕疑不自安。与中常侍赵忠，宋典等书说：大将军兄弟秉国专朝，如今与天下党人谋诛先帝左右，扫灭我曹。但以我蹇硕典禁兵，因此才沉吟未发。如今应当共闭上阁，赶快捕诛他们。
中常侍郭胜与何进同郡。太后及何进贵幸，有郭胜不少功劳。因此亲信何氏。与赵忠等商议，不从蹇硕之计，并将蹇硕书信给何进看。庚午，何进使黄门令收捕蹇硕并诛杀他。因悉领其屯兵。骠骑将军董重，与何进权势相害，中官挟董重以为党助，董太后每欲参干政事，何太后都遏制禁塞，董后愤怒的大骂说：你如今这么嚣张，不过是依仗你的兄长罢了。我敕令骠骑断何进之首，易如反掌。何太后闻言就告诉了何进。五月，何进与三公共奏孝仁皇后使故中常侍夏恽等交通州郡，辜较财利，悉入西省。故事，蕃后不得留京师。请求迁宫本国。奏可。
辛巳，何进举兵围骠骑府，收捕董重，免官自杀。六月辛亥，董太后忧怖暴崩。民间由是不附何氏。
辛酉，葬孝灵皇帝于文陵。何进有惩于蹇硕之谋，称疾不入陪丧，又不送山陵。大水。
秋七月，徙渤海王刘协为陈留王。司徒丁宫罢。袁绍又对何进说：以前窦武欲诛内宠，之所以反为所害，只是因为言语泄露，五营兵士皆畏服中人，而窦氏反而利用他们，因此自取祸灭。今将军兄弟，并领劲兵。部曲将吏，皆为英俊名士，乐尽力命。事在掌握，这可是天赞之时。将军应当一为天下除患。以垂名后世。时机不可失。何进于是白太后，请求尽罢中常侍以下。以三署郎官补其任。太后不听说：中官统领禁省，自古及今，是汉家故事，不可缺废。且先帝新弃天下，我奈何要衣冠楚楚的和天下士人共事呢？何进难违太后意，而且欲诛其放纵者，袁绍以为中官亲近至尊，出纳号令，今日若不悉数废黜，后必为患。而太后母舞阳君及何苗数受诸宦官贿遗，知道何进欲诛杀他们，数白太后，为他们障蔽。又说大将军专杀左右，擅权以弱社稷。太后疑以为然。何进新贵，素来敬惮中官。虽外慕大名，而内不能断。故事久不决。袁绍等又为划策。多招四方猛将及诸豪杰。使并引兵向京城。以胁迫太后。何进以为然。主簿广陵陈琳进谏说：谚语说掩目捕雀，微物尚不可欺以得志，何况国家大事。怎可以诈而立？今将军总皇威，握兵要，龙骧虎步，高下在心。这如同鼓洪炉燎毛发，但当速发雷霆，行权立断。则天人归顺。如今却要委释利器，更徵外助。大兵聚会，强者为雄。所谓倒持干戈，授人以柄。功必不成。只为乱阶罢了。
何进不听。